Il Finale divenne la “puerta a la mar” del Ducato di Milano, consentendo alle truppe spagnole di raggiungere i turbolenti teatri di guerra delle Fiandre.

Vari ingegneri e architetti militari al servizio della Spagna trasformarono il Finale in una piazzaforte militare, difesa da possenti fortificazioni bastionate.

Sulla costa, Castelfranco si sviluppò intorno al nucleo medievale prolungandosi lungo la dorsale montuosa del Gòttero con i forti dell’Annunziata, di Sant’Antonio e di Legnino.

Mentre sul crinale del Becchignolo sopra Finalborgo fu costruito Castel San Giovanni su progetto dell’architetto lombardo Francesco Prestino.

Non furono invece realizzati i grandiosi progetti, che prevedevano la costruzione di un grande porto a Varigotti o alla foce del Pora.

Nel 1666, quando arrivò nel Finale l’infanta Margherita in viaggio dalla Spagna per raggiungere Vienna dove doveva sposare l’imperatore Leopoldo d’Austria, fu costruito il maestoso arco di Margherita sulla piazza affacciata sul mare alla Marina. Nello stesso anno l’ingegnere Gaspare Beretta costruì in breve tempo la grande strada carrozzabile, che univa il Finale ad Alessandria e che da lui prese il nome.

La controversa dominazione spagnola, se da un lato comportò pesanti oneri fiscali e grandi spese per l’alloggiamento delle truppe, dall’altro segnò l’ascesa di famiglie locali che intesserono fruttuosi rapporti economici con l’amministrazione imperiale.

In questo periodo furono riscostruite in grandiose forme barocche le due grandi basiliche di San Biagio a Finalborgo e di San Giovanni alla Marina.